Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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