Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms