Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COG3Q96JB2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms