Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PERM1Q5SV97 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms