Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDRF1Q3B7T1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms