Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPROQ16827 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPROQ16827 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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