Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN3Q16667 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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