Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP4Q15650 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms