Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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CDSNQ15517 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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CDSNQ15517 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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CDSNQ15517 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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