Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ZNF343-203ENST00000381253 819 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 STEAP2-AS1-202ENST00000478318 627 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 IGKV2-28-201ENST00000482769 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 MIR345-201ENST00000362114 98 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 DHRS7-202ENST00000536410 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 BX284656.1-201ENST00000446364 668 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 AC010776.3-201ENST00000617349 424 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
RYR3Q15413 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms