Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DNASE1L3Q13609 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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DNASE1L3Q13609 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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DNASE1L3Q13609 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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DNASE1L3Q13609 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DNASE1L3Q13609 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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