Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD4Q13485 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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