Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MKRN3Q13064 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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