Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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FOXC1Q12948 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXC1Q12948 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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