Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TRAF2Q12933 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TRAF2Q12933 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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