Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMAN2Q12907 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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