Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH17Q12864 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms