Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FMODQ06828 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FMODQ06828 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FMODQ06828 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms