Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSPL2Q05D32 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSPL2Q05D32 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms