Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms