Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP7AQ04656 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms