Protein–RNA interactions for Protein: P78527

PRKDC, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKDCP78527 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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