Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1P60507 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms