Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC01547P58512 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms