Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLDN15P56746 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLDN15P56746 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLDN15P56746 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLDN15P56746 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CLDN15P56746 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CLDN15P56746 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CLDN15P56746 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CLDN15P56746 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CLDN15P56746 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CLDN15P56746 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CLDN15P56746 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CLDN15P56746 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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