Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIMK2P53671 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms