Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF6P49848 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF6P49848 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF6P49848 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF6P49848 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms