Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms