Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MCAMP43121 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MCAMP43121 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MCAMP43121 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MCAMP43121 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MCAMP43121 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms