Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD12P35452 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms