Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA3P32297 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms