Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A4P31645 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A4P31645 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms