Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FGFR3P22607 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms