Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMNB1P20700 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms