Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD8P13378 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms