Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SFTPCP11686 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms