Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 INTS6-AS1-204ENST00000593709 648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AP001020.2-201ENST00000581712 1605 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 SGO1-210ENST00000443724 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC100854.1-201ENST00000520351 341 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AL136088.1-201ENST00000531002 541 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms