Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC172P0C7W6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms