Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PKHD1P08F94 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PKHD1P08F94 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PKHD1P08F94 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PKHD1P08F94 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PKHD1P08F94 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PKHD1P08F94 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PKHD1P08F94 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
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PKHD1P08F94 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PKHD1P08F94 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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