Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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PTPRCP08575 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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PTPRCP08575 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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PTPRCP08575 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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PTPRCP08575 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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PTPRCP08575 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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PTPRCP08575 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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PTPRCP08575 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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