Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEF3O95398 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms