Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIOO75962 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIOO75962 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIOO75962 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIOO75962 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIOO75962 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIOO75962 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIOO75962 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIOO75962 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIOO75962 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIOO75962 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIOO75962 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIOO75962 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIOO75962 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIOO75962 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIOO75962 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIOO75962 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIOO75962 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIOO75962 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIOO75962 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIOO75962 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms