Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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HOXA3O43365 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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HOXA3O43365 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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HOXA3O43365 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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HOXA3O43365 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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HOXA3O43365 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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