Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTDSP2O14595 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms