Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EBAG9O00559 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms