Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HACD1B0YJ81 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms