Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGPD3A6NKT7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms