Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2F8A0AVK6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms