Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAI2Q9Y5P3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms