Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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